MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ferroplasma acidarmanus fer1

Total Repeats: 42146

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_021592	AT	3	6	172573	172578	50 %	50 %	0 %	0 %	518651500
4003	NC_021592	TA	3	6	172596	172601	50 %	50 %	0 %	0 %	518651500
4004	NC_021592	CAA	2	6	172650	172655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	518651500
4005	NC_021592	TTCA	2	8	172672	172679	25 %	50 %	0 %	25 %	518651500
4006	NC_021592	T	7	7	172732	172738	0 %	100 %	0 %	0 %	518651500
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4008	NC_021592	T	8	8	172800	172807	0 %	100 %	0 %	0 %	518651501
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4018	NC_021592	ATT	2	6	173342	173347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	518651501
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4053	NC_021592	ATC	2	6	174719	174724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	518651502
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4056	NC_021592	TA	3	6	174765	174770	50 %	50 %	0 %	0 %	518651503
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4099	NC_021592	ATA	2	6	176660	176665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4103	NC_021592	TAA	2	6	176784	176789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_021592	ATTAT	2	10	176856	176865	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_021592	TA	3	6	176919	176924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_021592	A	6	6	176951	176956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_021592	TAT	2	6	176970	176975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_021592	ATT	2	6	176976	176981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_021592	AT	3	6	176982	176987	50 %	50 %	0 %	0 %	518651504
4110	NC_021592	CAA	2	6	176989	176994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	518651504
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4112	NC_021592	GAG	2	6	177088	177093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	518651504
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4116	NC_021592	GA	3	6	177354	177359	50 %	0 %	50 %	0 %	518651504
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4121	NC_021592	A	6	6	177649	177654	100 %	0 %	0 %	0 %	518651504
4122	NC_021592	ATAC	2	8	177660	177667	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4123	NC_021592	GAA	2	6	177701	177706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_021592	T	6	6	177717	177722	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_021592	AATT	2	8	177741	177748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_021592	TTA	2	6	177749	177754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_021592	ATT	3	9	177765	177773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	518651505
4128	NC_021592	TTG	2	6	177810	177815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	518651505
4129	NC_021592	ATT	2	6	177836	177841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	518651505
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4131	NC_021592	TA	3	6	177955	177960	50 %	50 %	0 %	0 %	518651505
4132	NC_021592	AT	3	6	178003	178008	50 %	50 %	0 %	0 %	518651505
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4139	NC_021592	TA	3	6	178320	178325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4142	NC_021592	AT	3	6	178413	178418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4143	NC_021592	T	6	6	178495	178500	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4202	NC_021592	ATTT	2	8	181737	181744	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4232	NC_021592	TGG	2	6	183377	183382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	518651509
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4240	NC_021592	AATGG	2	10	183933	183942	40 %	20 %	40 %	0 %	518651510
4241	NC_021592	AC	3	6	183954	183959	50 %	0 %	0 %	50 %	518651510
4242	NC_021592	AATA	2	8	184023	184030	75 %	25 %	0 %	0 %	518651510
4243	NC_021592	TG	3	6	184057	184062	0 %	50 %	50 %	0 %	518651510
4244	NC_021592	ATG	2	6	184105	184110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	518651510
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4247	NC_021592	TGCAGC	2	12	184220	184231	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	518651510
4248	NC_021592	GAAG	2	8	184274	184281	50 %	0 %	50 %	0 %	518651510
4249	NC_021592	TTC	2	6	184335	184340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	518651510
4250	NC_021592	TTC	2	6	184397	184402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	518651510
4251	NC_021592	GTT	2	6	184485	184490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	518651510
4252	NC_021592	CCA	2	6	184523	184528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	518651510
4253	NC_021592	ATA	2	6	184557	184562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	518651510
4254	NC_021592	ATTT	2	8	184683	184690	25 %	75 %	0 %	0 %	518651511
4255	NC_021592	TCA	2	6	184726	184731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	518651511
4256	NC_021592	GCGAT	2	10	184753	184762	20 %	20 %	40 %	20 %	518651511
4257	NC_021592	TA	3	6	184804	184809	50 %	50 %	0 %	0 %	518651511
4258	NC_021592	CTG	2	6	184834	184839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	518651511
4259	NC_021592	CCA	2	6	184845	184850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	518651511
4260	NC_021592	AT	3	6	184938	184943	50 %	50 %	0 %	0 %	518651511
4261	NC_021592	CTG	2	6	185052	185057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	518651511
4262	NC_021592	ATAA	2	8	185092	185099	75 %	25 %	0 %	0 %	518651511
4263	NC_021592	ATT	2	6	185243	185248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	518651511
4264	NC_021592	ATT	2	6	185264	185269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	518651511
4265	NC_021592	CT	3	6	185271	185276	0 %	50 %	0 %	50 %	518651511
4266	NC_021592	ATC	2	6	185321	185326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	518651511
4267	NC_021592	TAT	2	6	185375	185380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	518651511
4268	NC_021592	AG	3	6	185387	185392	50 %	0 %	50 %	0 %	518651511
4269	NC_021592	ATTA	2	8	185414	185421	50 %	50 %	0 %	0 %	518651511
4270	NC_021592	AAT	2	6	185474	185479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	518651511
4271	NC_021592	GTT	2	6	185514	185519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	518651511
4272	NC_021592	TAT	2	6	185551	185556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	518651511
4273	NC_021592	ATT	2	6	185582	185587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	518651511
4274	NC_021592	ACTA	2	8	185612	185619	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4275	NC_021592	TTA	2	6	185653	185658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4276	NC_021592	TAT	2	6	185691	185696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4277	NC_021592	ATT	2	6	185716	185721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	518651512
4278	NC_021592	TAA	2	6	185722	185727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	518651512
4279	NC_021592	TA	3	6	185825	185830	50 %	50 %	0 %	0 %	518651512
4280	NC_021592	TCC	2	6	185838	185843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	518651512
4281	NC_021592	CTA	2	6	185872	185877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	518651512
4282	NC_021592	TA	4	8	185900	185907	50 %	50 %	0 %	0 %	518651512
4283	NC_021592	TTA	2	6	185992	185997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	518651512
4284	NC_021592	ATT	2	6	186014	186019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	518651512
4285	NC_021592	ATA	3	9	186038	186046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	518651512
4286	NC_021592	GGA	2	6	186074	186079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	518651512
4287	NC_021592	GTATGA	2	12	186115	186126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	518651512
4288	NC_021592	GAA	2	6	186162	186167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	518651512
4289	NC_021592	TCTT	2	8	186184	186191	0 %	75 %	0 %	25 %	518651512
4290	NC_021592	TGT	2	6	186218	186223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	518651512
4291	NC_021592	TAT	2	6	186308	186313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	518651512
4292	NC_021592	AGA	2	6	186372	186377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	518651512
4293	NC_021592	CTT	2	6	186400	186405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	518651512
4294	NC_021592	TAT	2	6	186406	186411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	518651512
4295	NC_021592	GCA	2	6	186477	186482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	518651512
4296	NC_021592	AT	3	6	186558	186563	50 %	50 %	0 %	0 %	518651512
4297	NC_021592	ATT	2	6	186579	186584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	518651512
4298	NC_021592	A	7	7	186589	186595	100 %	0 %	0 %	0 %	518651512
4299	NC_021592	GAATA	2	10	186601	186610	60 %	20 %	20 %	0 %	518651512
4300	NC_021592	TTG	2	6	186721	186726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	518651512
4301	NC_021592	TAA	2	6	186760	186765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	518651512
4302	NC_021592	GAA	2	6	186782	186787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	518651512
4303	NC_021592	T	6	6	186827	186832	0 %	100 %	0 %	0 %	518651512
4304	NC_021592	AGC	2	6	186849	186854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	518651512
4305	NC_021592	ATC	2	6	186873	186878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	518651512
4306	NC_021592	TTGA	2	8	186909	186916	25 %	50 %	25 %	0 %	518651512
4307	NC_021592	GCT	2	6	186929	186934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	518651512
4308	NC_021592	ATA	2	6	186943	186948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	518651512
4309	NC_021592	ATT	2	6	187002	187007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	518651512
4310	NC_021592	GTTT	2	8	187020	187027	0 %	75 %	25 %	0 %	518651512
4311	NC_021592	TTA	2	6	187036	187041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	518651512
4312	NC_021592	ACA	2	6	187116	187121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	518651512
4313	NC_021592	AG	3	6	187149	187154	50 %	0 %	50 %	0 %	518651512
4314	NC_021592	CTA	2	6	187162	187167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	518651512
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4316	NC_021592	A	6	6	187194	187199	100 %	0 %	0 %	0 %	518651512
4317	NC_021592	GAA	2	6	187212	187217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	518651512
4318	NC_021592	TA	3	6	187297	187302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4319	NC_021592	TAAA	2	8	187308	187315	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4320	NC_021592	CAT	2	6	187363	187368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4321	NC_021592	TATT	2	8	187403	187410	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4322	NC_021592	ATT	2	6	187413	187418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4323	NC_021592	T	6	6	187417	187422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4324	NC_021592	AAT	2	6	187492	187497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4325	NC_021592	TAA	2	6	187532	187537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4326	NC_021592	A	7	7	187559	187565	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4327	NC_021592	GAATA	2	10	187574	187583	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4328	NC_021592	ATAAA	2	10	187607	187616	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4329	NC_021592	TTATT	2	10	187719	187728	20 %	80 %	0 %	0 %	518651513
4330	NC_021592	TTTTC	2	10	187746	187755	0 %	80 %	0 %	20 %	518651513
4331	NC_021592	ATT	2	6	187849	187854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	518651513
4332	NC_021592	GA	3	6	187872	187877	50 %	0 %	50 %	0 %	518651513
4333	NC_021592	AT	3	6	187934	187939	50 %	50 %	0 %	0 %	518651513
4334	NC_021592	CATA	2	8	187947	187954	50 %	25 %	0 %	25 %	518651513
4335	NC_021592	TTA	2	6	187959	187964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	518651513
4336	NC_021592	TAC	2	6	188003	188008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	518651513
4337	NC_021592	T	6	6	188022	188027	0 %	100 %	0 %	0 %	518651513
4338	NC_021592	A	6	6	188059	188064	100 %	0 %	0 %	0 %	518651513
4339	NC_021592	ATTT	2	8	188129	188136	25 %	75 %	0 %	0 %	518651513
4340	NC_021592	TTTTA	2	10	188168	188177	20 %	80 %	0 %	0 %	518651513
4341	NC_021592	ATTT	2	8	188183	188190	25 %	75 %	0 %	0 %	518651513
4342	NC_021592	GTA	2	6	188270	188275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	518651513
4343	NC_021592	TAA	2	6	188283	188288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	518651513
4344	NC_021592	ATG	2	6	188294	188299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	518651513
4345	NC_021592	TAT	2	6	188309	188314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	518651513
4346	NC_021592	CATA	2	8	188349	188356	50 %	25 %	0 %	25 %	518651513
4347	NC_021592	ATCAC	2	10	188360	188369	40 %	20 %	0 %	40 %	518651513
4348	NC_021592	TA	3	6	188383	188388	50 %	50 %	0 %	0 %	518651513
4349	NC_021592	GCA	2	6	188396	188401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	518651513
4350	NC_021592	T	6	6	188504	188509	0 %	100 %	0 %	0 %	518651513
4351	NC_021592	TCCA	2	8	188511	188518	25 %	25 %	0 %	50 %	518651513
4352	NC_021592	ATC	2	6	188537	188542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	518651513
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4354	NC_021592	CATA	2	8	188667	188674	50 %	25 %	0 %	25 %	518651513
4355	NC_021592	TTA	2	6	188677	188682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	518651513
4356	NC_021592	ATG	2	6	188705	188710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	518651513
4357	NC_021592	CGC	2	6	188731	188736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	518651513
4358	NC_021592	ATG	2	6	188756	188761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	518651513
4359	NC_021592	A	6	6	188812	188817	100 %	0 %	0 %	0 %	518651513
4360	NC_021592	GTG	2	6	188861	188866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	518651513
4361	NC_021592	ATA	2	6	188907	188912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	518651513
4362	NC_021592	ACC	2	6	188949	188954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	518651513
4363	NC_021592	ATA	2	6	188973	188978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	518651513
4364	NC_021592	CAA	2	6	189007	189012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	518651513
4365	NC_021592	AAT	2	6	189062	189067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	518651513
4366	NC_021592	ATA	2	6	189306	189311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	518651513
4367	NC_021592	T	6	6	189387	189392	0 %	100 %	0 %	0 %	518651513
4368	NC_021592	ACC	2	6	189401	189406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	518651513
4369	NC_021592	CAG	2	6	189448	189453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	518651513
4370	NC_021592	TA	3	6	189513	189518	50 %	50 %	0 %	0 %	518651513
4371	NC_021592	AT	3	6	189584	189589	50 %	50 %	0 %	0 %	518651513
4372	NC_021592	TTAC	2	8	189597	189604	25 %	50 %	0 %	25 %	518651513
4373	NC_021592	TTCC	2	8	189618	189625	0 %	50 %	0 %	50 %	518651513
4374	NC_021592	AAT	2	6	189640	189645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	518651513
4375	NC_021592	TAT	2	6	189687	189692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	518651514
4376	NC_021592	T	6	6	189700	189705	0 %	100 %	0 %	0 %	518651514
4377	NC_021592	CTG	2	6	189719	189724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	518651514
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4379	NC_021592	TCAAC	2	10	189806	189815	40 %	20 %	0 %	40 %	518651514
4380	NC_021592	T	6	6	189818	189823	0 %	100 %	0 %	0 %	518651514
4381	NC_021592	ATT	2	6	189841	189846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	518651514
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4384	NC_021592	GCA	2	6	190246	190251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	518651514
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4394	NC_021592	TA	3	6	190726	190731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4422	NC_021592	ATG	2	6	192145	192150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	518651515
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4439	NC_021592	A	6	6	192921	192926	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4480	NC_021592	T	6	6	194803	194808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4481	NC_021592	AG	3	6	194877	194882	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4482	NC_021592	AAG	2	6	194913	194918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	518651518
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4487	NC_021592	CAT	2	6	195483	195488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4488	NC_021592	ATT	2	6	195493	195498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4489	NC_021592	ATTG	2	8	195536	195543	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4490	NC_021592	TATTG	2	10	195623	195632	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4491	NC_021592	TACA	2	8	195677	195684	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4492	NC_021592	CAAA	2	8	195705	195712	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4493	NC_021592	A	7	7	195710	195716	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4494	NC_021592	AT	4	8	195732	195739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4495	NC_021592	GAT	2	6	195747	195752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	518651519
4496	NC_021592	TAA	2	6	195773	195778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	518651519
4497	NC_021592	AGAAA	2	10	195860	195869	80 %	0 %	20 %	0 %	518651519
4498	NC_021592	GGA	2	6	196065	196070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	518651519
4499	NC_021592	TGG	2	6	196093	196098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	518651519
4500	NC_021592	GTT	2	6	196233	196238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	518651519

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